BioMart——一个查询导向的数据管理系统

Wisdom_love posted @ 2008年5月15日 20:56 in Bioinformatics , 1127 阅读

BioMart由欧洲生物信息研究所(EBI)和冷泉港实验室(ESHL)共同开发的一套查询导向的数据管理系统,这个系统可以接受任意格式的数据,也可 以按照不同的需求安装不同的查询工具和界面,可谓相当灵活。由于其内部采用关系型的数据组织模式,所以更易于进行复杂的数据挖掘研究。
BioMart内建有针对处理大量数据的最佳化查询功能,以便处理基因组序列或是微阵列实验数据等。对于分布于网络的多个数据集的交叉查 询,BioMart使之成为可能,从而避免了将这些数据全都下载到本地然后再进行整合查询的麻烦。可以通过网络、图表或者使用Perl、JAVA等语言写 的程序来访问BioMart的数据。目前,BioMart支持关系型数据平台MySQL,Oracle以及Postgres。
另外,BioMart是开源的,遵守LGPL协议。
网址:http://www.biomart.org/


登录 *


loading captcha image...
(输入验证码)
or Ctrl+Enter